Décrite par René Just Haüy, en 1806, du grec « apophylliso », "qui s'effeuille".  La triple tendance de ce minéral à l’exfoliation, par le feu, par les acides et par le frottement, a suggéré le nom d’apophyllite c'est-à-dire, qui s’exfolie. Des variantes chimiques ont été reconnues par Pete J. Dunn, Roland C. Rouse et Julie A. Norberg en 1978.

Un changement (2008) dans le système de nomenclature utilisé pour ce groupe a été approuvé par l'IMA, Association minéralogique internationale, supprima les préfixes des noms d'espèces et utilisa des suffixes pour désigner les espèces. Un nouveau changement de nomenclature ultérieur, approuvé par l'IMA, en 2014 a renommé les minéraux pour inclure à la fois des suffixes et des préfixes.

Faute d’analyses précises toutes les apophyllites sont aujourd’hui appelées « apophyllite » tout court ou aussi "fluorapophyllite", puisque la majorité sont effectivement des apophyllites-KF.

 

La localité type (topotype) est la mine de fer d’Uton (Utoë), Skärrgärde, province de Rostlagen, en Suède.

 

L'apophyllite est un minéral secondaire que l'on retrouve communément dans des amygdales du basalte ; dans des filons hydrothermaux, des skarns. Elle se forme essentiellement dans les vacuoles et fissures de roches cristallines et basiques à ultrabasiques, on la trouve aussi dans la paragenèse d'altération de filons métallifères.

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Les minéraux associés sont les zéolithes, mais aussi la calcite, le quartz, l'okénite, la datolite, la pectolite …